Kľúčovým rozdielom medzi NMR a röntgenovou kryštalografiou je, že NMR je analytická technika používaná na stanovenie typu a počtu atómov v organickej molekule, zatiaľ čo röntgenová kryštalografia je analytická technika používaná na stanovenie atómovej a molekulárnej štruktúry kryštálu.
Výraz NMR znamená nukleárna magnetická rezonancia. Tento termín spadá pod subtopickú spektroskopiu v analytickej chémii. Röntgenová kryštalografia je na druhej strane typ kryštalografickej techniky, pri ktorej používame röntgenový lúč na analýzu kryštálov.