Kľúčovým rozdielom medzi parazitom a baktériami je, že tieto baktérie sú jednobunkové mikroskopické prokaryoty, ktoré žijú všade, zatiaľ čo parazity sú organizmy, ktoré žijú na hostiteľoch alebo v nich a spôsobujú hostiteľom infekcie.
Parazit a baktérie sú organizmy, ktoré sa podobajú veľmi primitívnym organizmom, ale majú veľké adaptácie na prežitie v rôznych podmienkach prostredia. Pre ľudí sú tieto organizmy prvoradé, pretože väčšina ľudských infekcií je nimi spôsobená. Niekedy sa určité baktérie považujú za parazity.
