Kľúčový rozdiel medzi vnútorným a vonkajším dýchaním spočíva v tom, že vnútorné dýchanie sa vzťahuje na súbor metabolických reakcií, ktoré prebiehajú v bunkách na výrobu energie oxidáciou glukózy a iných organických molekúl, zatiaľ čo vonkajšie dýchanie sa týka procesu presunu kyslíka z vonkajšieho prostredia do buniek a presun oxidu uhličitého z tela do vonkajšieho prostredia.
Keď počujete výraz dýchanie, môže vám pripomínať proces nazývaný dýchanie. To je proces vdychovania a vydychovania vzduchu. Okrem tohto procesu však existuje ďalší proces dýchania, ktorý sa vyskytuje vo vnútri buniek organizmov. Je to proces nazývaný bunkové dýchanie. Preto sa tieto dva procesy, dýchanie a bunkové dýchanie, nazývajú ako vonkajšie dýchanie a vnútorné dýchanie. V mnohých aspektoch existujú rozdiely medzi vnútorným a vonkajším dýchaním. Napriek tomu vnútorné a vonkajšie dýchanie navzájom súvisia, pretože na vnútorné dýchanie sa používa kyslík, ktorý prichádza cez vonkajšie dýchanie, a vonkajšie dýchanie odstraňuje oxid uhličitý; vedľajší produkt vnútorného dýchania.
