Kľúčovým rozdielom medzi centromérou a chromomérom je, že centroméra je zúžená oblasť, ktorá spája sesterské chromatidy dohromady v chromozóme, zatiaľ čo chromomér je lineárne usporiadaná guľôčkovitá štruktúra prítomná po celej dĺžke chromozómu.
Chromozóm je vláknitá štruktúra zložená z nukleových kyselín a proteínov. Obsahujú genetickú informáciu organizmu. V chromozóme je niekoľko odlišných oblastí, medzi ktoré patria chromatidy, centroméry, chromoméry a teloméry. Centroméra je viditeľný bod zúženia v chromozóme. Spája sesterské chromatidy dohromady a je dôležitý počas bunkového delenia. Naproti tomu chromoméry sú pevne zvinutý chromatín prítomný po celej dĺžke chromozómu. Vyzerajú ako korálky na šnúrke. Nosia gény počas dedenia.
