Kľúčovým rozdielom medzi aktivovaným kalom a stekajúcim filtrom je to, že aktivovaným kalom je suspendovaný kultivačný systém, v ktorom je biomasa zmiešaná s odpadovými vodami, zatiaľ čo stekajúci filter je pripojeným kultivačným systémom, v ktorom sa biomasa pestuje na médiu a odpadové vody prechádzajú cez jej povrch.
Čistenie odpadových vôd je rozhodujúcim procesom na prevenciu chorôb prenášaných vodou a na udržanie zdravého životného prostredia pre všetkých. Mikroorganizmy, najmä baktérie, sa využívajú v procesoch čistenia odpadových vôd. Na biologickom čistení odpadových vôd sa okrem baktérií podieľajú aj nematódy a iné malé organizmy.