Kľúčovým rozdielom medzi izoláciou genómovej DNA a plazmidovej DNA je to, že izolácia genómovej DNA sa zameriava na extrakciu genómovej DNA, zatiaľ čo izolácia plazmidovej DNA sa zameriava na extrakciu plazmidovej DNA baktérií.
Izolácia DNA je chemický proces, ktorý sa používa na izoláciu DNA z rôznych druhov alebo z rôznych vzoriek. Izolácia DNA je dôležitá v následných technikách molekulárnej biológie, ako je napríklad gélová elektroforéza, polymerázová reťazová reakcia a techniky sekvenovania DNA. Preto je izolácia DNA v molekulárnych biologických štúdiách nevyhnutným chemickým procesom. Na základe účelu výskumu je niekedy potrebné izolovať genomickú DNA. Niektoré štúdie sa navyše zameriavajú na izoláciu plazmidovej DNA z baktérií. Izolácia genómovej DNA je proces izolácie genómovej DNA z prokaryotickej alebo eukaryotickej vzorky. Kroky izolácie sa líšia podľa typu bunky, v ktorej sa izoluje DNA. Izolácia plazmidovej DNA je proces izolácie plazmidovej DNA z bakteriálnej bunky. V porovnaní s izoláciou genomovej DNA,celkový proces je pri izolácii plazmidovej DNA zložitý.
