Kľúčový rozdiel medzi Iso a Sec v organickej chémii spočíva v tom, že výraz iso používame na pomenovanie organickej zlúčeniny obsahujúcej všetky atómy uhlíka okrem jedného, ktorý tvorí súvislý reťazec, zatiaľ čo výraz sec používame na identifikáciu funkčnej skupiny, ktorá je naviazaná na sekundárny uhlík atóm.
V organickej chémii existuje veľa predpôn, ktoré používame na identifikáciu skupín prítomných v zlúčeninách a na pomenovanie organických molekúl, aby sme ich od seba odlíšili. Lepší nomenklatúrny systém navyše dokáže pomenovať aj veľmi zložitú molekulu. Príklad: Nomenklatúra IUPAC je najlepší nomenklatúrny systém, ktorý poskytuje všetky podrobnosti o štruktúre chemickej zlúčeniny.
