Kľúčový rozdiel - plazmid vs transposon
Baktérie obsahujú chromozomálnu a nechromozomálnu DNA. Chromozomálna DNA hrá dôležitú úlohu pri raste baktérií. Nechromozomálna DNA nekóduje základné gény pre prežitie baktérií. Plazmid je typ prokaryotickej nechromozomálnej DNA. Sú to malé, kruhové dvojvláknové DNA, ktoré poskytujú baktériám ďalšie genetické výhody. Transpozón je sekvencia DNA, ktorá sa môže pohybovať na nových pozíciách v genóme. Sú tiež známe ako mobilný genetický materiál baktérií. Kľúčovým rozdielom medzi plazmidom a transpozónom je, že plazmid je nechromozomálna DNA, ktorá sa replikuje nezávisle v baktérii, zatiaľ čo transpozón je segment chromozomálnej DNA, ktorý sa translokuje v genóme baktérií a mení genetickú sekvenciu chromozómu.
OBSAH
1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo je plazmid
3. Čo je Transposon
4. Porovnanie vedľa seba - plazmid vs. Transposon
5. Zhrnutie
Čo je to plazmid?
Plazmid je extrachromozomálna DNA prokaryotov. Môže sa replikovať nezávisle od bakteriálneho chromozómu. Jedna baktéria môže mať vo vnútri niekoľko plazmidov. Plazmidy sú uzavreté kruhové kúsky DNA a sú malé. Plazmidová DNA nesie niekoľko génov, ktoré nie sú nevyhnutné na prežitie baktérie. Avšak tieto gény v plazmidoch poskytujú ďalšie genetické výhody pre baktérie, ako je rezistencia na antibiotiká, rezistencia na herbicídy, tolerancia na ťažké kovy atď. Špeciálne plazmidy nazývané plazmidy F faktora sa zúčastňujú bakteriálnej konjugácie, čo je sexuálna metóda reprodukcie.
Plazmidy sa používajú ako vektory v technológii rekombinantnej DNA a klonovaní génov. Plazmidy majú špeciálne vlastnosti, vďaka ktorým sú vhodné na použitie ako rekombinantné vektory v genetickom inžinierstve. Obsahujú počiatok replikácie, selekčné markerové gény, dvojvláknovú povahu, malú veľkosť a viac klonovacích miest. Vedci môžu ľahko otvoriť plazmidovú DNA a vložiť požadované fragmenty alebo gény DNA do plazmidov, aby vytvorili rekombinantnú DNA. Okrem toho je transformácia rekombinantného plazmidu na hostiteľskú baktériu ľahšia ako pri iných vektoroch.
Obrázok 01: Plazmidy
Čo je to Transposon?
Transpozón je fragment alebo sekvencia DNA, ktoré sa môžu translokovať v bakteriálnom genóme. Sú to mobilné sekvencie DNA. Pohybujú sa na nových miestach genómu. Tieto pohyby spôsobujú zmeny v postupnosti bakteriálneho genómu a spôsobujú významné zmeny v genetickej informácii. Sú to transponovateľné genetické prvky zodpovedné za vytváranie nových genetických sekvencií v baktériách. Transpozóny prvýkrát objavila Barbara McClintocková v 40. rokoch 20. storočia experimentmi s kukuricou a za svoju prácu bola ocenená Nobelovou cenou.
Transpozóny sa niekedy označujú ako skokové gény, pretože tieto skokové sekvencie môžu blokovať transkripciu génov a zmeniť usporiadanie genetického materiálu baktérie. Sú tiež zodpovední za pohyb génov rezistencie na lieky, génov rezistencie na antibiotiká medzi plazmidmi a chromozómami.
Existujú dva typy transpozónov založené na mechanizme, ktorý používajú na presun a vkladanie. Sú to transpozón triedy I (retrotranspozóny) a transpozón triedy II (DNA transpozóny). Transpozóny triedy I používajú mechanizmus „kopírovania a vkladania“, zatiaľ čo transpozóny triedy II používajú „mechanizmus kopírovania a vkladania“.
Transpozón sa môže pohybovať z plazmidu do chromozómu alebo medzi dvoma plazmidmi. Vďaka týmto pohybom sú gény zmiešané medzi bakteriálnymi druhmi. Transpozóny sa preto používajú ako vektory v genetickom inžinierstve na odstránenie a integráciu genetických sekvencií do organizmov.
Obrázok 02: Transpozón bakteriálnej DNA
Aký je rozdiel medzi plazmidom a transpozónom?
Rozdielny článok v strede pred tabuľkou
Plazmid vs Transposon |
|
Plazmid je malá kruhová dvojvláknová nechromozomálna DNA baktérií. | Transposon je segment DNA, ktorý je schopný sa pohybovať na nových miestach v genóme. |
Samoreplikácia | |
Plazmidy sú schopné replikovať sa nezávisle od chromozomálnej DNA. | Transpozóny sa nedokážu replikovať nezávisle. |
Špeciálne vlastnosti kódované | |
Plazmidy poskytujú niekoľko funkcií, ako je rezistencia na antibiotiká a virulencia. | Transpozóny nekódujú špeciálne znaky. |
Použiť ako vektor | |
Plazmidy sa používajú ako vektory v genetickom inžinierstve na výrobu rekombinantnej DNA. | Transpozóny sa tiež používajú ako vektory v genetickom inžinierstve na inzerčnú mutagenézu. |
Mutácie a zmeny v postupnosti | |
Plazmidy nie sú schopné spôsobiť významné mutácie a meniť sekvenciu a veľkosť genómu. | Transpozícia môže vytvoriť významné mutácie a zmeniť sekvenciu a veľkosť genómu. |
Zhrnutie - Plazmid vs Transposon
Plazmid je extrachromozomálna DNA, ktorá sa bežne nachádza v baktériách. Má schopnosť replikovať sa nezávisle od bakteriálnej chromozomálnej DNA. Plazmidy obsahujú gény, ktoré zvyšujú genetické výhody baktérií. Plazmidová DNA však nie je nevyhnutná na prežitie baktérií. Transpozóny sú mobilné genetické prvky, ktoré skáču z jedného miesta do nového v genóme. Sú schopné spôsobiť mutácie a meniť veľkosť a postupnosť genómu. To je rozdiel medzi plazmidom a transpozónom.