Kľúčovým rozdielom medzi plazmidom a chromozómom je, že plazmid je kruhová dvojvláknová extrachromozomálna DNA štruktúra baktérií, zatiaľ čo chromozóm je dobre organizovaná štruktúra podobná vláknu, ktorá obsahuje genómovú DNA pevne stočenú s proteínmi.
Bakteriálna bunka obsahuje chromozóm a niekoľko extrachromozomálnych kruhov DNA, ktoré sa nazývajú plazmidy. Bakteriálny chromozóm obsahuje genomickú DNA baktérií. Ďalej eukaryotická genómová DNA existuje tiež ako chromozómy. Ľudský genóm má 46 chromozómov. Všeobecne sú plazmidy prítomné v baktériách a archeaách. Aj keď majú baktérie plazmidy, plazmidy neobsahujú gény, ktoré sú nevyhnutné pre prežitie baktérií a ich hlavné funkcie. Plazmidy však obsahujú niekoľko génov, ktoré poskytujú ďalšie výhody baktériám, ako je rezistencia na antibiotiká, tolerancia voči suchu, rezistencia na herbicídy atď. Účelom tohto článku je podrobne diskutovať o rozdieloch medzi plazmidmi a chromozómami.
