Kľúčovým rozdielom medzi F plazmidom a R plazmidom je to, že F plazmid je extrachromozomálna DNA, ktorá obsahuje gény kódujúce faktor plodnosti. Medzitým je R plazmid extrachromozomálna DNA, ktorá obsahuje gény kódujúce rezistenciu proti antibiotikám.
Plazmid je malá kruhová dvojvláknová DNA prítomná v baktériách. Sú to extrachromozomálne DNA a sú schopné samoreplikácie. Nosia gény potrebné pre ich vlastnú replikáciu a údržbu. Okrem toho, že obsahujú gény potrebné na vlastnú replikáciu, plazmidy obsahujú aj niekoľko ďalších génov potrebných na kódovanie zvláštnych znakov, ako je rezistencia na antibiotiká, degradácia makromolekúl, tolerancia voči ťažkým kovom, produkcia bakteriocínov, prenos génov atď. prospešné pre baktérie.
Okrem toho existuje veľká škála plazmidov. R plazmidy a F plazmidy sú dva typy medzi nimi. F plazmid je plazmid plodnosti, ktorý je schopný konjugácie a produkcie sexuálnych pili. R plazmid je rezistenčný plazmid, ktorý je schopný poskytnúť rezistenciu proti antibiotikám a určitým inhibítorom rastu baktérií.