Kľúčový rozdiel - gélová elektroforéza vs SDS
Gélová elektroforéza je technika, ktorá oddeľuje makromolekuly v elektrickom poli. V molekulárnej biológii je bežnou metódou separácia DNA, RNA a proteínov zo zmesí podľa ich molekulárnej veľkosti. SDS Page je typ gélovej elektroforézy, ktorý sa používa na separáciu proteínov z proteínovej zmesi na základe ich veľkostí. Gélová elektroforéza je termín používaný na označenie bežnej techniky používanej na separáciu DNA, RNA a proteínov, zatiaľ čo SDS Page je jeden typ gélovej elektroforézy. Toto je kľúčový rozdiel medzi gélovou elektroforézou a SDS Page.
OBSAH
1. Prehľad a hlavný rozdiel
2. Čo je to gélová elektroforéza
3. Čo je SDS strana
4. Porovnanie vedľa seba - gélová elektroforéza vs. SDS strana
5. Zhrnutie
Čo je to gélová elektroforéza?
Gélová elektroforéza je bežná technika používaná v laboratóriách na separáciu nabitých molekúl, ako sú DNA, RNA, proteíny atď., Z ich zmesí. Pri gélovej elektroforéze sa používa gél. Funguje ako molekulárne sito. Pri gélovej elektroforéze sa používajú dva typy gélov, a to agaróza a polyakrylamid. Výber gélu a gélového prípravku sú dôležité faktory, ktoré je potrebné brať do úvahy pri gélovej elektroforéze, pretože s veľkosťou pórov gélu je potrebné opatrne manipulovať, aby sa molekuly dobre separovali gélovou elektroforézou. Gélová elektroforéza má elektrické pole spojené s dvoma koncami gélu. Jeden koniec gélu vykazuje kladný náboj, zatiaľ čo druhý koniec je záporne nabitý.
DNA a RNA sú negatívne nabité molekuly. Akonáhle sú nanesené do gélu od záporného konca gélu a aplikované na elektrické pole, migrujú cez póry gélu smerom k kladne nabitému koncu gélu. Rýchlosť migrácie závisí od náboja a veľkosti molekuly. Menšie molekuly ľahko migrujú cez gélové póry ako väčšie molekuly. Preto menšie molekuly prechádzajú gélom na veľkú vzdialenosť a väčšie molekuly na krátku vzdialenosť. Na pozorovanie pohybu molekúl na géle sa používajú špeciálne typy farbív. Elektrické pole sa aplikuje na určité časové obdobie a zastaví sa, aby sa zabránilo strate molekúl a aby sa molekuly udržali v pozíciách, ktoré prešli. V géle možno pozorovať rôzne pásy. Tieto pásy predstavujú molekuly rôznych veľkostí. Tedagélová elektroforéza je užitočná na rozlíšenie molekúl podľa ich veľkostí.
Gélová elektroforéza je začlenená do rôznych techník ako prípravná technika v molekulárnej biológii, ako je PCR, RFLP, klonovanie, sekvenovanie DNA, Southern blot, mapovanie genómu atď.
Obrázok 01: Elektroforéza na agarózovom géle
Čo je stránka SDS?
Gélová elektroforéza s dodecylsulfátom sodným na polyakrylamide (SDS Page) je typ gélovej elektroforézy používanej na separáciu proteínov. Keď sa na separáciu proteínov používa gélová elektroforéza, je potrebné špeciálne ošetrenie, pretože proteíny nie sú negatívne nabité ako DNA a RNA a nemigrujú smerom k pozitívnemu alebo negatívnemu koncu. Preto sú proteíny pred gélovou elektroforézou denaturované a pokryté negatívnym nábojom. Vykonáva sa pomocou čistiaceho prostriedku s názvom dodecylsulfát sodný (SDS). Gélová elektroforéza, ktorá používa SDS a polyakrylamidový gél pre nosné médium, je známa ako SDS Page. Táto technika sa bežne používa v biochémii, genetike, forenznej a molekulárnej biológii.
Počas SDS Page sa proteíny zmiešajú s SDS. SDS rozloží proteíny do lineárneho tvaru a obalí ich negatívnym nábojom úmerným ich molekulovej hmotnosti. Vďaka negatívnemu náboju molekuly proteínu migrujú smerom ku koncu gélu s pozitívnym nábojom a separujú sa podľa svojich molekulových hmotností. Na SDS Page sa ako tuhý podklad pre gél používa polyakrylamid. Skutočná separácia proteínov závisí hlavne od vlastností gélu. Preto by sa mala príprava polyakrylamidového gélu robiť opatrne a mali by sa používať správne koncentrácie polyakrylamidu. Polyakrylamidové gély vykazujú vysoké rozlíšenie ako agarózové gély. SDS Page je teda považovaný za techniku s vysokým rozlíšením na separáciu proteínov.
SDS Page je typ denaturačnej gélovej elektroforézy. Má veľké obmedzenie v analýze bielkovín. Pretože SDS denaturuje proteíny pred separáciou, neumožňuje detekciu enzymatickej aktivity, väzbových interakcií proteínov, proteínových kofaktorov atď.
Obrázok 02: Stránka SDS
Aký je rozdiel medzi gélovou elektroforézou a SDS Page?
Gélová elektroforéza vs SDS |
|
| Gélová elektroforéza je metóda uskutočňovaná na separáciu makromolekúl pomocou elektrického poľa. | SDS Page je technika gélovej elektroforézy s vysokým rozlíšením používaná na separáciu proteínov na základe ich hmotnosti. |
| Gélový beh | |
| Môže sa vykonávať horizontálnym alebo vertikálnym spôsobom. | Stránka SDS beží vždy vertikálne. |
| Základ pre rozchod | |
| K separácii dochádza podľa náboja a veľkosti. | K separácii proteínov dochádza podľa hmotnosti a náboja. |
| Rozhodnutie | |
| Elektroforéza na agarózovom géle má nízke rozlíšenie a polyakrylamidová gélová elektroforéza má vyššie rozlíšenie | Stránka SDS má lepšie rozlíšenie. |
| Denaturácia | |
| Gélová elektroforéza zahrnuje denaturačné aj nedenaturačné techniky. | Stránka SDS denaturuje proteíny pred separáciou. |
Zhrnutie - gélová elektroforéza vs karta bezpečnostných údajov
Gélová elektroforéza je bežná technika používaná na separáciu a analýzu DNA, RNA a proteínov na základe ich veľkosti a náboja. Existujú dva hlavné typy gélovej elektroforézy, a to agarózová gélová elektroforéza a polyakrylamidová gélová elektroforéza. Agarózové gély sa používajú hlavne na separáciu nukleových kyselín; ak sa vyžaduje vyššie rozlíšenie, použijú sa polyakrylamidové gély. SDS Page je typ gélovej elektroforézy, ktorý sa bežne používa na separáciu zložitých zmesí proteínov. Je považovaná za techniku separácie proteínov s vysokým rozlíšením. To je rozdiel medzi gélovou elektroforézou a SDS Page.
