Kľúčovým rozdielom medzi špecifickosťou substrátu a špecifickosťou väzby je to, že substrátovou špecificitou je schopnosť enzýmu zvoliť presný substrát, s ktorým sa môže naviazať, zo skupiny podobných zlúčenín, zatiaľ čo špecifickosť väzby je schopnosť enzýmu zvoliť substráty s podobnými väzbami a podobné štruktúry.
Pojmy substrátová špecifickosť a väzbová špecificita spadajú do oblasti biochémie, pokiaľ ide o aktivitu enzýmov. Enzým môžeme definovať ako biologický katalyzátor. To znamená, že enzýmy sú zlúčeniny, ktoré môžu zvýšiť rýchlosť biologických funkcií, ktoré prebiehajú v bunkách, ale počas funkcie sa nespotrebúvajú. Termín špecificita sa týka spôsobu, ktorým sa konkrétny enzým viaže s konkrétnym substrátom.