Kľúčovým rozdielom medzi konzervatívnou a konsenzuálnou sekvenciou je, že konzervovaná sekvencia sa týka podobných sekvencií nukleových kyselín alebo aminokyselín, ktoré sa vyskytujú u rôznych alebo rovnakých druhov po celé generácie, zatiaľ čo konsenzuálna sekvencia je bežne sa vyskytujúca nukleotidová sekvencia alebo aminokyselinová sekvencia nachádzajúca sa vo vysoko konzervatívnej oblasti. DNA alebo RNA alebo proteínu.
Organizmy zdieľajú podobné aj odlišné vlastnosti. Pri štúdiu vzťahov medzi organizmami a ich klasifikácii je veľmi dôležitý genóm alebo genetická výbava organizmov. Existuje niekoľko nukleotidových alebo aminokyselinových sekvencií, ktoré sú bežné medzi rôznymi organizmami. Konzervovaná sekvencia je sekvencia nukleovej kyseliny alebo aminokyseliny, ktorá je konzistentná medzi druhmi. Preto sú pri generovaní fylogenetických stromov fylogeneticky dôležité. V konzervovaných sekvenciách existujú špecifickejšie nukleotidové sekvencie, ktoré sa vyskytujú častejšie. Sú známe ako konsenzuálne sekvencie.
