Kľúčovým rozdielom medzi metódou agarovej jamky a metódou difúzie disku je, že pri metóde difúzie agarovej jamky sa extraktový roztok plní do otvoru alebo jamky vytvorenej na agarovom médiu, zatiaľ čo pri metóde difúzie agarového disku sa používa disk filtračného papiera obsahujúci testovací roztok. umiestnené na povrchu agaru.
Mikroorganizmy sú pôvodcami mnohých chorôb. Existujú rôzne antimikrobiálne látky, ktoré ničia mikroorganizmy a bránia alebo zastavujú ich rast. Na detekciu antimikrobiálnej aktivity sú k dispozícii rôzne skríningové a hodnotiace metódy. Medzi nimi sú bežne používané metódy difúzie agarových jamiek a difúzie agarových diskov v in vitro analýze, čo sú metódy difúzie agaru. Tieto metódy sú široko používané, pretože nevyžadujú špecifikované vybavenie a ďalšie hodnotenie z hľadiska reprodukovateľnosti a štandardizácie. Obidve metódy závisia od difúzie antimikrobiálneho činidla agarovým médiom.
