Kľúčovým rozdielom medzi autológnou a alogénnou transplantáciou kmeňových buniek je, že pri transplantácii autológnych kmeňových buniek sa pri transplantácii používajú vlastné bunky, zatiaľ čo pri alogénnej transplantácii kmeňových buniek sa darca pred transplantáciou porovnáva a potom sa podáva.
Transplantácia kmeňových buniek je technika, ktorá sa používa hlavne pri liečbe rakoviny. Pri transplantácii kmeňových buniek sa kmeňové bunky s vhodnými pokročilými vlastnosťami podávajú tak, aby sa z nich vyvinuli imunologické bunky schopné ničiť rakovinové bunky. Jeho ďalšou funkciou je ochrana nezhubných buniek v tele. Autológne a alogénne transplantácie kmeňových buniek sú dva typy techník transplantácie kmeňových buniek. Autológna transplantácia kmeňových buniek využíva na transplantáciu vlastné kmeňové bunky, zatiaľ čo alogénna transplantácia kmeňových buniek využíva kmeňové bunky porovnaného darcu.
