Kľúčovým rozdielom medzi celkovým počtom buniek a počtom životaschopných buniek je to, že celkový počet buniek odhaduje všetky bunky vrátane živých aj mŕtvych mikrobiálnych buniek vo vzorke, zatiaľ čo počet životaschopných buniek odhaduje iba živé mikrobiálne bunky vo vzorke.
Počítanie počtu organizmov v populácii sa považuje za potrebné pre väčšinu experimentálnych prác. Preto sa snažíme analyzovať počet mikróbov vo vzorke pomocou priamych a nepriamych metód. Priame merania zahŕňajú metódy, ktoré počítajú počet buniek priamo. Nepriame merania zahŕňajú meranie niektorých parametrov, ktoré môžu súvisieť s počtom buniek, ako je hustota buniek, suchá hmotnosť atď. Niektoré metódy kvantifikujú iba živé mikrobiálne bunky vo vzorke. Jednou z takýchto metód je počet životaschopných buniek. Priame mikroskopické počty kvantifikujú všetky bunky v známom objeme média / vzorky pomocou mikroskopu. Preto počíta živé aj mŕtve bunky. Je to typ celkového počtu buniek.
