Kľúčovým rozdielom medzi iónovou dvojicou a iónovo-výmennou chromatografiou je to, že pri iónovej párovej chromatografii môžu byť ióny vo vzorke „spárované“a oddelené ako iónový pár, zatiaľ čo pri iónovo-výmennej chromatografii môžu byť ióny vo vzorke oddelené ako katióny a anióny zvlášť.
Chromatografia je dôležitá technika, ktorá vedie k separácii rôznych zložiek v zmesi. Iónový pár a iónomeničová chromatografia sú analytické techniky, ktoré môžeme použiť na separáciu iónov a polárnych molekúl v zmesi na základe elektrického náboja, ktorý so sebou nesú.