Kľúčovým rozdielom medzi efektom zakladateľa a genetickým driftom je, že efektom zakladateľa je udalosť genetického driftu, pri ktorej sa malá skupina rozdelí od hlavnej populácie a vytvorí kolóniu, zatiaľ čo genetický drift označuje náhodné zmeny frekvencií alel v malých populáciách, ktoré spôsobujú zmiznutie konkrétnych génov v čase.
Evolúcia je proces, ktorý vysvetľuje zmenu znakov v organizmoch v priebehu nasledujúcich generácií. Evolúcia sa spolieha na prírodný výber a genetický drift. Vďaka prirodzenému výberu zostávajú v populáciách priaznivé charakteristiky, zatiaľ čo nepriaznivé charakteristiky sa z populácií časom znižujú. Podobne genetický drift spôsobuje náhodné zmeny vo frekvenciách alel v malých populáciách v dôsledku náhodného zmiznutia konkrétnych génov v dôsledku úmrtia alebo zabránenia reprodukcii. Efekt zakladateľa a efekt úzkeho miesta sú dve udalosti genetického driftu.
