Kľúčovým rozdielom medzi mezenchymálnymi a krvotvornými kmeňovými bunkami je, že mezenchymálne kmeňové bunky sa môžu diferencovať na neuróny, kosti, chrupavky, svaly a bunky tukového tkaniva, zatiaľ čo krvotvorné kmeňové bunky sa môžu diferencovať na všetky typy krviniek v tele.
Kmeňové bunky sú nediferencované alebo nešpecializované bunky prítomné v našom tele. Sú schopné deliť sa a dávať rovnaký typ kmeňových buniek alebo diferencovať sa na špecializované bunky v tkanivách, ktoré majú určené funkcie. Vďaka týmto pozoruhodným schopnostiam kmeňových buniek sa používajú na opravu a regeneráciu poškodených tkanív. Mesenchymálne kmeňové bunky a krvotvorné kmeňové bunky sú dva typy kmeňových buniek, ktoré sú mimoriadne dôležité. Mesenchymálne kmeňové bunky (nehematopoetické kmeňové bunky) sú multipotentné kmeňové bunky, ktoré môžu generovať bunky kostí, chrupaviek a tukov. Na druhej strane krvotvorné kmeňové bunky môžu tvoriť všetky typy krviniek v tele. Okrem toho sú oba tieto typy kmeňových buniek prítomné v kostnej dreni.
