Kľúčovým rozdielom medzi chlorofylom a karotenoidmi je, že chlorofyl je skupina zelených farebných pigmentov, ktoré sa primárne používajú na fotosyntézu fotosyntetických organizmov, zatiaľ čo karotenoidy sú skupinou žltých až červených farebných pigmentov vrátane karoténov a xantofylov, ktoré sú doplnkovými pigmentmi.
Pigment je farebná chemická zlúčenina, ktorá odráža určitú vlnovú dĺžku viditeľného svetla. Je zodpovedný za poskytnutie charakteristických farieb mnohým predmetom, vrátane kvetov, farieb, ovocia, listov, koralov atď. Konkrétny pigment absorbuje určitú vlnovú dĺžku viditeľného svetla a odráža inú vlnovú dĺžku, ktorá je viditeľná našim voľným okom. Vo fotosyntetických organizmoch zohrávajú v procese fotosyntézy hlavnú úlohu zelené farebné pigmenty nazývané chlorofyly. Ďalšia skupina pigmentov nazývaná karotenoidy je tiež schopná absorbovať svetlo, ale nemôže sa do nich priamo zapojiť fotosyntetická dráha. Sú to žlté, oranžové a červené farebné pigmenty.
