Kľúčový rozdiel medzi chlorofylom A a B spočíva v tom, že chlorofyl A je primárnym fotosyntetickým pigmentom v rastlinách a riasach, zatiaľ čo chlorofyl B je doplnkovým pigmentom, ktorý zhromažďuje energiu a prechádza na chlorofyl A.
Chlorofyl je skupina prírodných pigmentov, ktoré sú prítomné v rastlinách a riasach a je zodpovedný za ich zelenú farbu. Chlorofyl absorbuje energiu zo slnečného žiarenia a túto energiu využíva na syntézu sacharidov z vody a oxidu uhličitého. Je to proces nazývaný fotosyntéza, ktorý udržiava životné procesy vo všetkých rastlinách, pretože týmto procesom sú splnené ich energetické požiadavky. Ďalej je fotosyntéza hlavným procesom, ktorý udržuje všetky živé organizmy, pretože rastliny sú primárnymi producentmi všetkých potravinových reťazcov. Zvieratá a ľudia konzumujú produkty rastlín. V rodine chlorofylových pigmentov existuje niekoľko typov chlorofylových pigmentov. Medzi nimi sú chlorofyl A a chlorofyl B dva typy chlorofylov. Majú podobnú štruktúru s miernym rozdielom v porfyrínovom kruhu. Chlorofyl A má CH3 skupiny v porfyrínovom kruhu, zatiaľ čo chlorofyl B má CHO (aldehydovú skupinu) v porfyrínovom kruhu.