Kľúčovým rozdielom medzi CRP a homocysteínom je to, že C reaktívny proteín (CRP) je pentamérny proteín, zatiaľ čo homocysteín je neproteinogénna alfa aminokyselina.
Zápal je komplexná biologická reakcia vyvinutá proti rôznym škodlivým stimulom, ako sú patogény, poškodené bunky v tele alebo dráždivé látky. Zahŕňa imunitné bunky, molekulárne mediátory a krvné cievy. Okrem toho rôzne markery naznačujú možné zápalové stavy. Preto sa tieto markery používajú na klinických úrovniach na identifikáciu rôznych chorobných stavov súvisiacich so zápalom. C reaktívny proteín (CRP) a homocysteín sú dva také markery.