Kľúčový rozdiel medzi telami Golgi a mitochondrií je v ich funkcii. Hlavnou funkciou Golgiho teliesok (alebo Golgiho aparátu) je modifikácia, triedenie a balenie proteínov na sekréciu, zatiaľ čo hlavnou funkciou mitochondrií je produkcia energetickej meny bunky (ATP) dýchaním.
Eukaryotické bunky obsahujú bunkové organely, ako sú Golgiho telieska, mitochondrie, lyzozómy, ribozómy, jadro atď. Sú to životne dôležité organely potrebné pre bunkové funkcie. Golgiho telieska sú súčasťou endomembránového systému, ktorý sa skladá z vezikúl a zložených membrán, zatiaľ čo Mitochondrie sú dvojité membránovo viazané fazuľovité organely nachádzajúce sa v eukaryotických bunkách.