Kľúčový rozdiel medzi primárnou a sekundárnou alylickou karbokáciou je ten, že primárna alylická karbokácia je menej stabilná ako sekundárna alylická karbokácia.
Allylová karbokácia je uhlíková štruktúra stabilizovaná rezonanciou. Je to ión obsahujúci kladný náboj. V týchto iónoch je kladný ión umiestnený na alylovom atóme uhlíka (alylický uhlíkový atóm je susedným atómom dvojitej väzby). Primárna alylická karbokácia je alylická karbokácia, kde je kladný náboj umiestnený na primárnom atóme uhlíka, zatiaľ čo sekundárna alylická karbokácia je alylická karbokácia, kde je kladný náboj umiestnený na sekundárnom atóme uhlíka.