Kľúčový rozdiel medzi jednoduchým proteínom a konjugovaným proteínom je v tom, že jednoduché proteíny sú tvorené z aminokyselín spojených dohromady za vzniku veľkej molekuly, zatiaľ čo konjugované proteíny sú zložité molekuly obsahujúce jednoduché proteíny a neproteínové zložky.
Proteín je molekula biopolyméru. To znamená; molekula proteínu obsahuje množstvo opakujúcich sa jednotiek naviazaných na kovalentné väzby. Tieto opakujúce sa jednotky predstavujú aminokyseliny, ktoré sa používali pri tvorbe proteínu. Podľa chemického zloženia proteínov existujú dva typy proteínov, ako sú jednoduché proteíny a konjugované proteíny.