Kľúčovým rozdielom medzi hierarchickým a úplným sekvenovaním brokových zbraní je to, že pri hierarchickom sekvenovaní brokových zbraní je genóm pred sekvenovaním rozbitý na väčšie fragmenty, zatiaľ čo pri sekvenovaní brokových zbraní z celého genómu je celý genóm rozložený na malé fragmenty.
Sekvenovanie je dôležitá technika v molekulárnych procesoch, najmä pri presnej identifikácii druhov. V skutočnosti ide o techniku identifikácie presného poradia nukleotidov v géne alebo genóme. Existuje mnoho techník na sekvenovanie. Niektoré z nich zahŕňajú Maxam Gilbertovu metódu, Sangerovu metódu a automatizovanú Sangerovu metódu.