Kľúčovým rozdielom medzi sekvenovaním brokovnice a sekvenovaním novej generácie je to, že sekvenovanie brokovnice je metóda sekvenovania, ktorá náhodne rozdeľuje sekvencie DNA na veľa malých fragmentov a opätovne zostavuje sekvenciu pozorovaním prekrývajúcich sa oblastí, zatiaľ čo sekvenovanie ďalšej generácie (NGS) je pokročilou metódou genetické sekvenovanie, ktoré závisí od kapilárnej elektroforézy.
Sekvenovanie je proces, ktorý určuje presné poradie nukleotidov v géne, zoskupení génov, chromozóme a úplnom genóme. V genomických štúdiách, forenzných štúdiách, virológii, biologickej systematike, lekárskej diagnostike, biotechnológii a v mnohých ďalších oblastiach je veľmi dôležité analyzovať štruktúru a funkciu génov a identifikáciu organizmov. Ďalej sú k dispozícii rôzne typy metód sekvenovania. Sekvenovanie brokových zbraní a sekvenovanie ďalšej generácie sú dve pokročilé metódy.
