Kľúčový rozdiel medzi skupinou a skupinou v biológii je ten, že skupina je skupina úzko príbuzných taxónov, ktorá sa skúma na vývojové vzťahy, zatiaľ čo skupina je referenčná skupina alebo taxón mimo záujmovú skupinu a vzdialenejšie súvisí s danou skupinou.
Kladistika alebo fylogenetika je najbežnejšie používanou metódou v biologickej klasifikácii. Používa najnovšieho spoločného predka na kategorizáciu organizmov do skupín alebo kladov. Z kladistickej analýzy nakoniec vznikne kladogram, čo je stromový diagram predstavujúci fylogenetické vzťahy medzi organizmami. Kladistika teda pomáha určovať evolučné vzťahy medzi druhmi, najmä monofyletickými organizmami. Outgroup a ingroup sú dve skupiny definované v kladistike. Podskupina je skupina taxónov, ktorá sa skúma na účely určenia evolučných vzťahov. Sú to príbuzné taxóny alebo sesterské taxóny. Naopak, outgroup je referenčná skupina, ktorá je mimo záujmovej skupiny. Outgroup je vzdialene príbuzný s ingroup.