Kľúčovým rozdielom medzi oomycetami a zygomycetami je, že oomycety neobsahujú chitín na svojich bunkových stenách, ale naopak obsahujú celulózu, beta glukány a aminokyselinu hydroxyprolín, zatiaľ čo zygomycety obsahujú chitosan na svojich bunkových stenách. Ďalším rozdielom medzi oomycetami a zygomycetami je, že vegetatívny stav oomycetov je diploidný, zatiaľ čo zygomycety sú haploidné alebo dikaryotické.
Oomycety a zygomycety sú mikroskopické eukaryotické organizmy. Oomycéty pripomínajú skutočné huby. Ale sú to vodné formy. Zygomycety sú jednou z hlavných tried kmeňa Zygomycota, ktoré sú pravými hubami. Sú to všadeprítomné, saprofytické, environmentálne huby.