Kľúčovým rozdielom medzi bunkou sprostredkovanou a protilátkou sprostredkovanou imunitou je to, že bunkou sprostredkovaná imunita ničí infekčné častice bunkovou lýzou cytokínmi bez produkcie protilátok, zatiaľ čo imunita sprostredkovaná protilátkami ničí patogény produkciou špecifických protilátok proti antigénom.
Bunkami sprostredkovaná imunita a imunita sprostredkovaná protilátkami sú dva typy primárnych obranných mechanizmov prebiehajúcich v našom tele. Bunkami sprostredkovaná imunita pôsobí proti intracelulárnym patogénom. Preto pracuje vo vnútri infikovaných buniek a ničí patogény uvoľňovaním cytokínov. Naproti tomu imunita sprostredkovaná protilátkami pôsobí proti extracelulárnym patogénom tak, že vytvára protilátky proti antigénom prítomným mimo infikovaných buniek alebo voľne cirkulujúcich v krvi. Okrem toho B lymfocyty vykonávajú hlavne imunitu sprostredkovanú protilátkami, zatiaľ čo T lymfocyty imunitu sprostredkovanú bunkami.
