Kľúčový rozdiel medzi lišajníkmi a mycorrhizae je ten, že lišajník je mutualistická asociácia, ktorá existuje medzi riasami / sinicami a hubami, zatiaľ čo mycorrhiza je typomualistic- kej asociácie vyskytujúcej sa medzi koreňmi vyššej rastliny a hubou.
Mutualizmus je jedným z troch typov symbiózy, ktorá sa vyskytuje medzi dvoma rôznymi druhmi organizmov. Na rozdiel od ostatných dvoch typov je vzájomnosť prospešná pre oboch partnerov, ktorí sú v združení. Lichen a mycorrhizae sú dva bežné príklady mutualistických asociácií. Oba sú ekologicky dôležité vzťahy. Dve strany lišajníka sú riasy alebo sinice a huba. Na druhej strane, dve strany mykoríz sú korene vyššej rastliny a huby.