Kľúčový rozdiel medzi formálnou a neformálnou organizáciou spočíva v tom, že formálne organizácie sa vytvárajú na dosiahnutie spoločného cieľa s oficiálnymi vzťahmi medzi členmi, zatiaľ čo neformálne organizácie sa formujú v rámci formálnych organizácií na základe medziľudských vzťahov medzi členmi organizácie.
Formálne aj neformálne koncepcie organizácie navzájom súvisia. Je to preto, lebo v rámci formálnych organizácií existuje veľa neformálnych organizácií. Formálna organizácia podporovaná mnohými neformálnymi organizáciami je navyše efektívna a uspokojivá organizácia.