Kľúčový rozdiel medzi nefrídiami a malpighianskými tubulmi závisí od ich výskytu v organizmoch. Nefrídie sú prítomné v nižších organizmoch, ako sú červy a mäkkýše, zatiaľ čo malpighianske tubuly sú prítomné v zadných oblastiach hmyzu a suchozemských článkonožcov.
Vylučovanie je dôležitým aspektom živých organizmov. Metabolické dráhy generujú rôzne produkty vylučovania ako vedľajšie produkty. Hromadenie odpadu v systéme živého tela je však toxické a škodlivé. Preto je nevyhnutnosťou prítomnosť mechanizmu na odstránenie metabolického odpadu z tela prostredníctvom systému vylučovania. Preto sú rôzne druhy vylučovacích orgánov prítomné v rôznych skupinách organizmov. Dva príklady takýchto vylučovacích orgánov sú nefrídie a malpighianske tubuly.
