Kľúčovým rozdielom medzi polymérom a makromolekulou je, že polymérom je makromolekula s opakujúcou sa jednotkou nazývanou monomér v celej molekulárnej štruktúre, zatiaľ čo nie každá makromolekula má vo svojej štruktúre monomér.
Rozdiel medzi polymérom a makromolekulou vyplýva zo skutočnosti, že polymér je podskupinou makromolekuly. Makromolekuly sú extrémne veľké molekuly s vysokou molekulovou hmotnosťou. Tiež môžeme rozdeliť makromolekulu do dvoch hlavných kategórií podľa jej štruktúry. Konkrétne ide o polymerizované molekuly a nepolymerizované molekuly. Na druhej strane polymér vzniká z polymerizácie malých molekúl, ktorými sú monoméry. Všetky makromolekuly ale neobsahujú monomérnu jednotku opakujúcu sa v celej svojej štruktúre.