Kľúčový rozdiel medzi komplementárnymi a doplnkovými génmi je v tom, že komplementárne gény vyžadujú prítomnosť každého génu pri expresii znaku, zatiaľ čo iba jeden gén z dvoch doplnkových génov vyžaduje pri expresii znaku prítomnosť druhého génu.
Gény pri vytváraní znaku u jednotlivca navzájom ovplyvňujú. Tieto interakcie sú zložité a vyžadujú si hĺbkovú analýzu, aby bolo možné pochopiť, ako spolupracujú, a ako prítomnosť génov ovplyvňuje expresiu znakov. Doplnkové a doplnkové gény sú dva také druhy génov, ktoré pri produkcii znaku interagujú navzájom. Vykazujú epistatické interakcie génov, čo znamená, že účinok jedného génu závisí od prítomnosti druhého génu.
