Rozdiel Medzi VNTR A STR

2024 Autor: Mildred Bawerman | [email protected]. Naposledy zmenené: 2023-12-16 08:42

Kľúčový rozdiel - VNTR vs STR

Štúdie DNA majú nesmiernu užitočnosť pri porozumení a určovaní fylogenetických vzťahov, diagnostike genetických chorôb a mapovaní genómov organizmu. Na identifikáciu konkrétneho génu alebo sekvencie DNA v skupine neznámej DNA sa používa niekoľko techník spojených s analýzou DNA. Sú známe ako genetické markery. Genetické markery sa používajú v molekulárnej biológii na identifikáciu genetických variácií medzi jednotlivcami a druhmi. Tandemová repetícia s variabilným počtom (VNTR) a krátka tandemová repetícia (STR) sú dva typy genetických markerov, ktoré u jednotlivcov preukazujú polymorfizmus. Oba typy sú nekódujúce opakujúce sa DNA, ktoré sú tandemovými opakovaniami. Sú usporiadané spôsobom po hlave v chromozómoch. VNTR je časť genómu, kde sa krátka nukleotidová sekvencia opakuje niekoľkokrát. STR je ďalšia časť DNA v genóme, ktorá je organizovaná ako opakujúce sa jednotky pozostávajúce z dvoch až trinástich nukleotidov stokrát. Kľúčovým rozdielom medzi VNTR a STR je počet nukleotidov v opakujúcej sa sekvencii. Opakujúce sa jednotky VNTR pozostávajú z 10 až 100 nukleotidov, zatiaľ čo opakujúce sa jednotky STR pozostávajú z 2 až 13 nukleotidov. VNTR a STR sa široko používajú v forenzných štúdiách.

OBSAH

1. Prehľad a hlavný rozdiel

2. Čo je VNTR

3. Čo je STR

4. Podobnosti medzi VNTR a STR

5. Porovnanie vedľa seba - VNTR vs. STR v tabuľkovej forme

6. Zhrnutie

Čo je VNTR?

Tandemová repetícia je krátka sekvencia DNA, ktorá sa opakuje od hlavy po chvost na špecifickom chromozomálnom mieste. V tandemovej repetícii nie je žiadna iná sekvencia alebo nukleotid. V genóme je niekoľko druhov tandemových repetícií. VNTR je typ tandemovej repetície, ktorá má opakujúce sa jednotky pozostávajúce z 10 až 100 nukleotidov. VNTR je typ mini-satelitu. Tieto tandemové repetície sa nachádzajú v mnohých chromozómoch. Sú rozptýlené v ľudskom genóme a nachádzajú sa predovšetkým v subtelomerických oblastiach chromozómov.

VNTR ukazujú polymorfizmus tandemového opakovania medzi jednotlivcami. Dĺžka VNTR v konkrétnom mieste chromozómu je medzi jednotlivcami veľmi variabilná v dôsledku variácií v počte opakujúcich sa jednotiek organizovaných v tejto sekcii DNA. Preto môže byť VNTR použitý ako silný nástroj pri identifikácii jednotlivcov a analýza VNTR sa využíva v mnohých oblastiach vrátane genetiky, biologického výskumu, forenznej analýzy a DNA odtlačkov prstov. VNTR boli prvými genetickými markermi používanými na kvantifikáciu prihojenia transplantátu kostnej drene. VNTR boli tiež prvými polymorfnými markermi používanými pri profilovaní DNA vo forenznej oblasti.

Obrázok 01: Zmeny VNTR u šiestich jedincov

Analýza VNTR sa uskutočňuje pomocou polymorfizmu s dĺžkou restrikčných fragmentov, po ktorom nasleduje južná hybridizácia. Preto potrebuje porovnateľne veľkú vzorku DNA. Problematická je aj interpretácia profilu VNTR. Z dôvodu týchto obmedzení bolo použitie VNTR vo forenznej genetike obmedzené a bolo nahradené analýzou STR.

Čo je STR?

STR je vysoko repetitívny úsek DNA, ktorý pozostáva z dvoch až trinástich nukleotidových opakujúcich sa jednotiek usporiadaných tandemovým spôsobom. STR je podobný ako VNTR. Ale líši sa od VNTR od počtu nukleotidov v opakujúcej sa sekvencii a počtu opakovaní. STR je typ mikrosatelitu.

STR analýza zahrnutá do merania presného počtu opakujúcich sa jednotiek. STR sú medzi jednotlivcami veľmi variabilné, podobné ako VNT. Profily STR sa líšia od človeka k človeku. Preto sa STR analýza používa v molekulárnej biológii na porovnanie špecifických lokusov na DNA z dvoch alebo viacerých vzoriek. Preto sú STR považované za silné genetické markery v molekulárnej biológii. Poskytuje vynikajúci nástroj na identifikáciu jednotlivcov kvôli ich vysokému stupňu polymorfizmu a relatívne krátkej dĺžke.

V súčasnosti sú STR najbežnejšie používaným analyzovaným nástrojom genetického polymorfizmu vo forenznej genetike. Väčšina forenzných prípadov zahŕňa STR polymorfnú analýzu. STR lokusy sú rozšírené po celom genóme. V chromozómoch sú tisíce STR, ktoré sa dajú použiť pri forenznej analýze. Analýza STR nezahŕňa polymorfizmus s obmedzenou dĺžkou, ako je analýza VNTR. STR analýza neštiepi DNA reštrikčnými enzýmami. Na pripojenie požadovaných oblastí na DNA sa používajú špecifické sondy a pomocou techniky PCR sa určujú dĺžky STR.

Obrázok 02: STR variácia medzi vzorkami

Aké sú podobnosti medzi VNTR a STR?

VNTR a STR sú nekódujúca DNA.
Obidve sú tandemové opakovania.
Oba ukazujú polymorfizmus medzi jednotlivcami z dôvodu rozdielu v dĺžke úseku DNA.
Oba sa používajú ako silné genetické markery pri tlači prstov DNA a pri forenzných štúdiách.

Aký je rozdiel medzi VNTR a STR?

Rozdielny článok v strede pred tabuľkou

VNTR vs STR
VNTR je nekódujúca opakujúca sa DNA, ktorá má krátku nukleotidovú sekvenciu opakovanú tandemovým spôsobom.	STR je vysoko repetitívny úsek DNA, ktorý pozostáva z dvoch až trinástich nukleotidových opakujúcich sa jednotiek usporiadaných tandemovým spôsobom.
Veľkosť
VNTR sú väčšie ako STR.	STR sú menšie ako VNTR.
Počet nukleotidov v opakujúcej sa sekvencii
Opakujúca sa jednotka VNTR pozostáva z 10 až 100 nukleotidov.	Opakujúca sa jednotka STR pozostáva z 2 až 13 nukleotidov.

Zhrnutie - VNTR vs STR

VNTR a STR sú dva silné genetické markery používané v molekulárnej biológii, najmä v oblasti forenznej genetiky. VNTR je typ minisatelitu a STR je mikrosatelit. VNTR a STR sú nekódujúca, vysoko repetitívna DNA. Sú to tandemové opakovania. Všeobecná štruktúra VNTR a STR je rovnaká. Počet nukleotidov v opakujúcej sa sekvencii a dĺžka sú však rôzne. VNTR má opakujúce sa sekvencie pozostávajúce z 10 až 100 nukleotidov. STR má opakujúce sa sekvencie pozostávajúce z 2 až 13 nukleotidov. To je rozdiel medzi VNTR a STR.

Stiahnite si PDF verziu VNTR vs STR

Môžete si stiahnuť verziu tohto článku vo formáte PDF a použiť ho na offline účely podľa citácií. Tu si stiahnite verziu PDF. Rozdiel medzi VNTR a STR.