Kľúčový rozdiel - metabolomika vs. metabonomika
Metabolity sú malé molekuly zapojené do metabolických reakcií v bunkách. Medzi metabolity patria metabolické medziprodukty, hormóny, sekundárne metabolity, signálne molekuly atď. Sú to fungujúce molekuly biochemických reakcií buniek. Kompletná sada metabolitov biologickej vzorky alebo jedného organizmu je známa ako metabolome. Metabolome je dynamická kolekcia, ktorá sa v tele mení každú sekundu. Metabolomika a metabonomika sú dva pojmy súvisiace so štúdiom metabolomu organizmu. Kľúčový rozdiel medzi metabolomikou a metabonomikou je v tom, že metabolomika sa viac zaoberá normálnym endogénnym metabolizmom a metabolickým profilovaním na bunkovej alebo orgánovej úrovni, zatiaľ čo metabonomika sa viac zaoberá rozšírením metabolického profilovania o informácie o poruchách metabolizmu v dôsledku faktorov prostredia, chorôb, čreva. mikroorganizmy a porovnanie metabolického profilovania atď. Metabolomika je riadená hlavne hmotnostnou spektrometriou a metabonomika využíva na analýzu metabolitov NMR spektroskopiu.
OBSAH
1. Prehľad a hlavný rozdiel
2. Čo je
to metabolomika 3. Čo je metabonomika
4. Porovnanie vedľa seba - metabolomika vs. metabonomika
5. Zhrnutie
Čo je metabolomika?
Metabolológia je štúdium metabolických procesov, ktoré sa vyskytujú v bunkách, biokvapalinách, tkanivách alebo organizmoch. Zahŕňa identifikáciu a kvantifikáciu bunkových metabolitov pomocou dobrých analytických a štatistických nástrojov. Metabolológia sa považuje za dôležitú štúdiu, pretože odhaľuje informácie o metabolizme organizmu.
Na štúdium substrátov a produktov metabolických reakcií používa metabolomika ako analytickú platformu hmotnostnú spektrometriu. Hmotnostná spektrometria odhaľuje typy metabolitov a ich koncentrácie, odrážajúce skutočný biochemický stav buniek alebo tkanív. Preto možno metabolomiku považovať za najlepšieho zástupcu molekulárneho fenotypu organizmu. Metabolomika je omická technológia malých molekúl organizmov v porovnaní s inými štúdiami omicu; metabolomika je veľmi dôležitá, pretože priamo odráža súčasný stav biochemickej reakcie buniek.
Metabolomiku je tiež možné považovať za rozšírenie proteomiky, pretože sa vytvára v dôsledku aktivít enzýmov, ktoré sú proteínmi, ako je znázornené na nasledujúcom obrázku.
Obrázok 01: Metabolologická schéma
Čo je metabonomika?
Metabonomika je definovaná ako kvantitatívne meranie multiparametrických metabolických reakcií v konkrétnych časoch vo vzťahu k patofyziologickým stresom alebo genetickým modifikáciám. Spravidla sa to vzťahuje na štúdie o výžive ľudí a reakciách na lieky alebo choroby. Tento prístup bol priekopníkom Jeremy Nicholsona na Imperial College v Londýne a používal sa v mnohých oblastiach vrátane toxikológie, diagnostiky chorôb, výživy atď. Historicky bola metabonomika jednou z prvých metód na uplatnenie rozsahu systémovej biológie na štúdium. metabolizmu.
Metabonomics sa skôr zameriava na porovnanie biochemických profilov ako na identifikáciu jednotlivých metabolických zlúčenín v metabolomike. Metabonomiku možno preto definovať ako podmnožinu metabolomiky. Zdôrazňuje hlavne porovnanie metabolických profilov rôznych populácií s ohľadom na choroby, stresy životného prostredia, genetické modifikácie, výživa, lieky atď., Pretože metabolity sú dobrými markermi, ktoré signalizujú chorobné stavy, účinky liekov, environmentálne stresy, vystavenie toxínom, atď.
Metabonomické štúdie odhaľujú intracelulárne aj extracelulárne metabolity. Využíva vysokovýkonné techniky na súčasnú a opakovanú analýzu veľkého množstva metabolitov, čo umožňuje dočasné vyšetrenie fyziologického stavu buniek. Odhaľuje tiež koreláciu medzi metabolitmi a patologickým stavom organizmu. Na podporu metabonomických štúdií možno použiť genomiku a proteomiku, pretože sú vzájomne prepojené, ako je znázornené na obrázku vyššie.
Aký je rozdiel medzi metabolomikou a metabonomikou?
Rozdielny článok v strede pred tabuľkou
Metabolomika vs metabonomika |
|
| Metabolomika je štúdium kompletnej skupiny metabolitov organizmu | Metabonomics je kvantitatívna štúdia multiparametrických metabolických reakcií živých systémov na časovej báze na patofyziologické stimuly alebo genetické modifikácie. |
| Hlavné zameranie | |
| Metabolomics sa viac venuje metabolickému profilovaniu a identifikácii jednotlivých metabolitov prítomných v bunkách. | Metabonomics sa viac zaoberá porovnávaním metabolitov alebo metabolických profilov populácií vo vzťahu k genetickým modifikáciám, chorobám, environmentálnym stresom, patologickým stimulom, drogám atď. |
| Informácie | |
| Metabolológia je zameraná hlavne na endogénny metabolizmus. | Metabonomika sa neobmedzuje iba na endogénny metabolizmus. Rozširuje sa o informácie o poruchách metabolizmu spôsobených vnútornými a vonkajšími faktormi, ako sú stravovacie návyky, toxíny, chorobné procesy atď. |
| Analytické nástroje | |
| Ako hlavná analytická platforma používa hmotnostnú spektrometriu | Metabonomics využíva NMR spektroskopiu ako hlavnú analytickú platformu. |
Zhrnutie - Metabolomika vs. metabonomika
Metabolome predstavuje úplnú sadu malých molekúl nazývaných metabolity prítomné v bunke alebo v organizme. Metabolomika je štúdium celého metabolomu na vytvorenie metabolického profilu. Metabolomika umožňuje vedcom merať skutočný fyziologický stav bunky alebo organizmu. Metabonomika je súčasťou metabolomiky, ktorá sa rozširuje o získanie informácií o multiparametrických metabolických reakciách živých systémov na patofyziologické podnety a genetické modifikácie. Metabonomics sa nezaoberá iba individuálnym metabolickým profilovaním, ako je metabolomika; porovnáva metabolické profily vo vzťahu k iným faktorom, ako sú environmentálne stresy, choroby, toxíny atď. Metabolomika aj metabonomika zahŕňajú štúdie metabolitov organizmov na meranie skutočného fyziologického stavu buniek. Tedaniekedy sa tieto dve slová považujú za synonymá, bez ohľadu na rozdiel medzi metabolomikou a metabonomikou.
