Kľúčovým rozdielom medzi rodokmeňom a karyotypom je, že rodokmeň je znázornením vzoru dedenia konkrétneho znaku medzi členmi tej istej rodiny, zatiaľ čo karyotyp je diagramom, ktorý ukazuje počet chromozómov a konštitúciu v bunkovom jadre jednotlivca.
Rodokmeň predstavuje rodinnú anamnézu konkrétnej vlastnosti, najmä dedičnosť génu. Karyotyp je diagram, ktorý ukazuje počet chromozómov a zloženie v jadre bunky jedinca. Odhaľuje informácie týkajúce sa počtu, veľkosti, tvaru, polohy centromér chromozómov atď. Pod svetelným mikroskopom. Rodokmeň aj karyotyp poskytujú dôležité informácie týkajúce sa genetických chorôb.
