Kľúčovým rozdielom medzi karyotypom a idiogramom je, že karyotyp je skutočným obrazom celkových chromozómov bunky, zatiaľ čo idiogram je schematickým diagramom karyotypu, ktorý ilustruje všetky mapy chromozómov.
Sada chromozómov predstavuje genóm a genetickú informáciu organizmu. Každý chromozóm má jedinečný tvar, veľkosť a súbor génov. Počet a fyzikálne štruktúry chromozómov odhaľujú dôležité informácie týkajúce sa organizmu. Karyotypizácia je technika vykonaná na vyšetrenie kompletnej sady chromozómov v bunke. Počas tohto testu sa zhromažďujú a analyzujú celkové chromozómy, aby sa určilo, či sa v chromozómoch vyskytujú numerické alebo štrukturálne abnormality. Aktuálny obrázok, ktorý zobrazuje celkové chromozómy bunky, je karyotyp, zatiaľ čo schematický diagram celkových chromozómov bunky je idiogram. Obidve sú dôležité v cytogenetických štúdiách.
