Kľúčovým rozdielom medzi zloženým heterozygotom a dvojitým heterozygotom je to, že zloženým heterozygotom je jedinec, ktorý má dve rôzne mutované alely v konkrétnom lokusu génu, zatiaľ čo dvojitý heterozygot je jedinec, ktorý je heterozygot v dvoch samostatných genetických lokusoch.
Gén má spravidla dve alely, pretože organizmy sú diploidné. Alely sú variantné formy génu. Nachádzajú sa na genetickom mieste chromozómu. Existujú dominantné alely aj recesívne alely. Ak má jednotlivec dve odlišné alely (jedna dominantná a jedna recesívna (Aa)) pre dané miesto, hovoríme tomu heterozygot. Podmienka mať dve rôzne alely pre gén sa nazýva heterozygotný stav. Zložený heterozygot a dvojitý heterozygot sú dva typy heterozygotných situácií. Zlúčenina heterozygot má dve rôzne mutované alely v konkrétnom génovom mieste. Dvojitý heterozygot je heterozygotný na dvoch lokusoch génu.
