Kľúčovým rozdielom medzi genómovou a plazmidovou DNA je to, že genómová DNA je nevyhnutná pre prežitie organizmov vrátane baktérií, zatiaľ čo plazmidová DNA nie je nevyhnutná pre prežitie baktérií.
Každý živý organizmus má genetický materiál, ktorý riadi jeho celkové fungovanie. Genetický materiál existuje hlavne ako chromozomálna DNA. U eukaryotov je genómová DNA prítomná vo vnútri jadra, zatiaľ čo u prokaryotov je genomická DNA prítomná v cytoplazme. Iné ako chromozomálna DNA alebo genómová DNA majú niektoré organizmy vrátane baktérií, archaeí a kvasiniek extrachromozomálnu DNA známu ako plazmidová DNA. Plazmidová DNA nie je nevyhnutná pre každodenné fungovanie týchto organizmov. Poskytujú však týmto organizmom ďalšie výhody, pretože obsahuje niekoľko dôležitých génov. Je tiež dôležité poznamenať, že tieto gény nie sú také dôležité ako gény prítomné v genómovej DNA. Tento článok sa teda pokúša diskutovať o rozdieloch medzi genómovou a plazmidovou DNA.