Kľúčový rozdiel medzi alfa a beta anomérmi je ten, že v alfa anoméri je hydroxylová skupina na anomérnom uhlíku cis k exocyklickému kyslíku v anomérnom centre, zatiaľ čo v beta anoméri je hydroxylová skupina trans k exocyklickému kyslíku.
Anomér je geometrická variácia medzi sacharidmi. Je to typ epiméru, v ktorom môžeme vidieť anomérny atóm uhlíka. Anomérny atóm uhlíka je odvodený od karbonylového uhlíka štruktúry s otvoreným reťazcom uhľohydrátu. Preto sa tvorba cyklickej štruktúry zo štruktúry s otvoreným reťazcom nazýva anomerizácia.