Kľúčový rozdiel medzi alfa a beta tubulínom spočíva v tom, že alfa tubulín obsahuje Asp-254 v E-mieste, zatiaľ čo beta-tubulín obsahuje Lys-254 v N-mieste. Okrem toho je GTP vždy pripojený k alfa-tubulínovej podjednotke, zatiaľ čo u beta-tubulínovej podjednotky je GTP vymeniteľný za mikrovlákna, ktoré majú polymerizovať.
Mikrotubuly sú súčasťou cytoskeletu cytoplazmy eukaryotických buniek. Preto mikrotubuly existujú ako sieť proteínových vlákien distribuovaných po celej bunke, ktoré poskytujú bunkám určitý tvar a udržiavajú organely na svojom mieste. Skladajú sa navyše z dvoch hlavných tubulínových proteínov, a to alfa a beta tubulínov. Alfa a beta sú dve rodiny nadrodiny eukaryotických tubulínov. Alfa a beta tubulín existujú ako dimér a sú základnou stavebnou jednotkou mikrotubulov.