Kľúčový rozdiel medzi alfa a beta hydroxykyselinami je v tom, že alfa hydroxykyselina (AHA) má skupinu karboxylovej kyseliny a hydroxylovú skupinu oddelenú jedným atómom uhlíka, zatiaľ čo beta hydroxykyselina (BHA) obsahuje skupinu karboxylovej kyseliny a hydroxylovú skupinu oddelenú dvoma atómami uhlíka.
Hydroxykyseliny sú organické zlúčeniny, ktoré majú skupinu karboxylovej kyseliny aj hydroxylovú skupinu v tej istej molekule. Atómy uhlíka, ku ktorým sú tieto funkčné skupiny pripojené, sú v tesnej blízkosti. Preto ich môžeme pomenovať ako alfa, beta alebo gama podľa počtu atómov uhlíka, ktoré tieto funkčné skupiny oddeľujú. V nasledujúcom texte si povieme viac podrobností.