Kľúčový rozdiel medzi pyridínom a pyrimidínom spočíva v tom, že pyridínová štruktúra pripomína štruktúru benzénu, pričom jedna metylová skupina je nahradená atómom dusíka, zatiaľ čo pyrimidínová štruktúra, aj keď pripomína štruktúru benzénu, má dve metylové skupiny nahradené atómami dusíka.
Pyridín a pyrimidín sú organické zlúčeniny. Tieto sa nazývajú ako heterocyklické organické zlúčeniny, pretože sú to cyklické štruktúry, ktoré majú dva rôzne typy atómov tvoriacich kruh. Tieto kruhové štruktúry obsahujú atómy uhlíka a dusíka.
