Kľúčový rozdiel medzi receptormi AMPA a NMDA je, že špecifickým agonistom receptora AMPA je kyselina alfa-amino-3-hydroxy-5-metyl-4-izoxazolpropiónová (AMPA), zatiaľ čo špecifickým agonistom receptora NMDA je N-metyl - D - aspartát (NMDA).
Existujú tri hlavné typy glutamátových receptorov. Ich rozdiel je založený na agonistovi, ktorý sa viaže na aktiváciu receptora pre väzbu glutamátu. Väzba glutamátu otvorí iónovo riadené kanály na transport sodíkových a draselných iónov. Receptory NMDA tiež uľahčujú tok iónov vápnika cez membránu.
