Kľúčový rozdiel medzi receptormi H1 a H2 spočíva v tom, že receptor H1 sa spája s Gq / 11 stimulujúcou fosfolipázu C, zatiaľ čo receptor H2 interaguje s Gs a aktivuje tak adenylyl cyklázu.
Histamín je organická dusíkatá zlúčenina, ktorá zahŕňa lokálne imunitné reakcie. Ďalej funguje ako neurotransmiter v centrálnom nervovom systéme a maternici. Podieľa sa na zápalových reakciách a funguje ako mediátor svrbenia. Bazofily a žírne bunky generujú histamín a histamín zvyšuje permeabilitu kapilár pre biele krvinky a proteíny potrebné na pôsobenie proti infekčným agensom. Aby sa dosiahol účinok histamínu, mal by sa viazať na histamínové receptory spojené s G proteínom. Existujú štyri typy histamínových receptorov, konkrétne H1, H2, H3 a H4. H1 a H2 sú prítomné v asociácii s centrálnym nervovým systémom a perifériami. Rozdiel medzi receptormi H1 a H2 teda spočíva hlavne v mechanizme ich pôsobenia.