Kľúčový rozdiel medzi kyselinou jablčnou a kyselinou maleínovou je ten, že kyselina jablčná je nasýtená dikarboxylová kyselina, zatiaľ čo kyselina maleínová je nenasýtená dikarboxylová kyselina.
Kyselina jablčná a kyselina maleínová sú dikarboxylové kyseliny. To znamená, že tieto zlúčeniny obsahujú dve karboxylové skupiny (-COOH) v tej istej molekule pripojené k dvom rôznym atómom uhlíka. Rozdiel medzi kyselinou jablčnou a kyselinou maleínovou spočíva v nasýtení (prítomnosť dvojitých alebo trojitých väzieb znamená nenasýtenie). Pretože kyselina maleínová má dvojitú väzbu medzi dvoma atómami uhlíka, je to nenasýtená zlúčenina. Ale medzi atómami uhlíka kyseliny jablčnej nie sú žiadne dvojité alebo trojité väzby.