Kľúčovým rozdielom medzi teóriou molekulárnych dráh a teóriou valenčných väzieb je to, že teória molekulárnych dráh popisuje formovanie molekulárnych dráh, zatiaľ čo teória valenčných väzieb popisuje atómové orbitaly.
Rôzne molekuly majú odlišné chemické a fyzikálne vlastnosti ako jednotlivé atómy, ktoré sa spojili a vytvorili tieto molekuly. Aby sme pochopili tieto rozdiely medzi atómovými a molekulárnymi vlastnosťami, je potrebné porozumieť vzniku chemickej väzby medzi niekoľkými atómami, aby vznikla molekula. V súčasnosti používame dve kvantovo mechanické teórie na opísanie kovalentnej väzby a elektronickej štruktúry molekúl. Ide o teóriu valenčných väzieb a teóriu molekulárnej orbity.
