Kľúčový rozdiel medzi glykogénom a glukózou spočíva v tom, že glykogén je polysacharid, ktorý ukladá sacharidy u zvierat a húb, zatiaľ čo glukóza je najhojnejším monosacharidom, ktorý funguje ako primárny zdroj energie v bunkách.
Sacharidy sú organické zlúčeniny charakterizované prvkami uhlíka, vodíka a kyslíka. Pomer vodíka a kyslíka je 2: 1 v uhľohydrátoch, podobne ako vo vode. Sacharidy sú veľmi dôležité rozšírené biologické zlúčeniny, pretože sú hlavným zdrojom energie a štrukturálnou zložkou protoplazmy. Sacharidy sú všeobecne biele, pevné a rozpustné v organických tekutinách, okrem určitých polysacharidov. Monosacharidy sú základné jednotky molekúl uhľohydrátov a najdôležitejšia z nich je glukóza. Glykogén je tiež sacharid. Ale je to polysacharid tvorený anabolizmom molekúl glukózy na rozvetvenú molekulu. Glukóza aj glykogén sú dôležité pri výrobe energie v tele. Glukóza je hlavným palivom na výrobu energie a glykogén je druh sekundárneho,dlhodobé skladovanie energie u zvierat a húb.
